詹姆斯·库克大学的前身是汤斯维尔大学院，建于1961年，正式建成詹姆斯-库克大学是在1970年。 1987年又在凯恩斯建立分校园。学校共有Townsville（汤斯维尔市），Cairns（凯恩斯市），Sydney（悉尼），Melbourne（墨尔本），Singapore（新加坡）等五个校区。凯恩斯校区和汤斯维尔校园处于低山环抱的绿色地带，凯恩斯黏土地带终年湿热，水草丰茂；汤斯维尔地带略呈干热，桉树环合，热带风光无所不见。

该校是澳洲的第一座热带大学，它除了提供学科上的研究、研究训练以及教学课程外，还在与热带地区有关的一些学术领域内有很强的实力。该校的研究吸引了大量外来基金，并与工业部门和政府互相协作。

大学与诸如大堡礁海洋公园组织，澳大利亚海洋学院、基础工业部与澳糖类研究所等机构协作紧密。