香港法例《香港理工大學條例》生效，理工學院獲大學及理工教育資助委員會頒授自我評審資格，正式取得大學地位，並正名為“香港理工大學”

2000年6月1日，香港理工大學獲李嘉誠基金會捐贈一億元港幣，基金會主席李嘉誠博士於捐贈儀式上親自將一億元支票交給理大校董會主席胡應湘爵士和校長潘宗光教授。 [21]

2003年，香港理工大學工商管理學院正式成立；航運及物流管理學系更名為物流學系，並成立香港第一所國際物流及航運研究中心。

2004年，理大獲微軟資助成立Microsoft企業系統中心，該中心內置有總值達六千萬元的商業軟件及先進器材，內裡的實驗室共分為四部分，包括物流與摸擬、商業自動化、流動商業與知識管理方案等。

2007年5月29日，香港理工大學與浙江大學舉辦兩校辦學十週年慶典暨中心新址揭幕儀式，慶祝合作辦學十週年及兩校校慶，雙方於浙大校園啟用“國際企業培訓中心”新址。

2008年，香港理工大學獲邀參與北京奧運會主場館“鳥巢”和中央電視台總部大樓的建築工程  ；同年9月1日，理大語文及傳意學院易名為人文學院 。

2009年，香港政府撥款四百萬港元予香港航運獎學金，支持理大培育航運及物流界年青專才  ；同年，理大與英國倫敦大學皇家獸醫學院合辦全港首個動物護理學士課程。

2010年11月25日，香港理工大學獲孫中山先生孫女、孫逸仙和平教育基金會主席孫穗芳博士厚贈一尊孫中山先生銅像，豎立於理大邵逸夫體育館地下大堂。

2011年9月27日，香港理工大學全資擁有的五星級教研酒店唯港薈正式開幕；10月4日，香港理工大學獲歐盟資助二百六十萬歐元，與十二所海外大學研究多語及多元文化主義，理大是香港及全東南亞第一所獲得歐盟資助EM交流項目的大學[30] ；10月13日，清華大學—香港理工大學語言科學中心成立。

2012年7月27日，北京大學－香港理工大學中國社會工作研究中心“思善苑”在北大校園正式揭幕。北大校長周其鳳院士致歡迎辭，高度評價與理大二十多年來的合作所取得的豐碩成果。