学科建设

基尔大学学的重点专业有：海洋生物学，国民经济学和斯堪的纳维亚文化；另外，基尔大学的国际经济系和自然灾害研究所亦享有较高的国际声誉。

在德国精英大学的评选中，基尔大学共有3个项目（或学院）入选，分别是：未来海洋学（The Future Ocean）、炎症与免疫（Inflammation at Interfaces）项目以及人类发展与景观设计综合研究生院（Graduate School for Integrated Studies of Human Development in Landscapes）。

在英国大学研究水平评估中，基尔大学的法律学院被评为5*，英语学院，应用数学系，历史学院，美国研究学院，政治，国际关系及环境学院，医学科学技术中心被评为5。 此外，一项对社会政策与治理委员会的跨学院提案也被评为5。

基尔大学在心理，生物，俄语，音乐，商业和管理研究以及社区临床医学等专业领域都在英国大学研究水平评估中获得高分。 

院系专业

基尔大学共包括九个学院神学院（Theologie）、法学院（Rechtswissenschaften）、经济-社会科学学院（Wirtschafts- und Sozialwissenschaften）、医学院（Medizin）、人文学院（Philosophie）、数学-自然科学学院（Mathematik-Naturwissenschaft）、农业学院（Agrarwissenschaften）、教育学院（Erziehungswissenschaften）、技术学院（Technik）等九个学院80个专业，其专业领域从考古学、药物学到罗马语直至动物学，此外还为在校学生提供音乐、文化和体育等丰富多彩的课外活动。

由于拥有众多的重点研究课题、特殊研究领域、同时有博士授予资格、其研究生院和一群闻名的学院使基尔大学的教学独树一帜。其165个院系、医院及其他机构分别分布在250多栋大楼内；此外，还拥有三个占地面积约500公顷的可耕农田的实验农场；基尔大学的中心图书馆（Zentralbibliothek）和各院系的专业图书馆藏有各类专业图书达550多万册。基尔大学的法律地位和编制是依据石勒苏益格-荷尔斯泰因州的高校法确立的，大学是公法的法人，其最高管理者是校长办公室，由校长、两名副校长和总务长组成；大学最重要的管理机构有大学评议会、监理会和各系务会。