大学课程渐趋职业导向，教学内容少了一些理论科学。可是，这所年轻的学府仍面临财政危机，并受到管理层的关注。在这“波士顿理工”的岁月里，学校的前教职员、时任哈佛大学校长的查尔斯·艾略特曾六度建议将麻省理工并入当时哈佛学院的劳伦斯科学院。

位于狭窄的后湾区的麻省理工学院无法负担进一步的校园扩展费用，而学生的人数却不断上升，使之日趋拥挤。学校急需基金或捐款以维持正常运作。最终，校方在师生、校友的强烈反对下接受了与哈佛合并的邀请，惟1917年马萨诸塞州最高法院以反大学垄断的理由禁止了此举，结束了这场“合并风波”。

1916年，麻省理工学院迁移至查尔斯河剑桥市的岸边，临近哈佛大学，沿岸伸延逾1英里（1.6千米），此为填海土地。这充满新古典主义建筑风格的“新理工”校园，由建筑师威廉·W·博斯沃思设计，受惠于一位匿名“好心人”的捐助，这位先生自1912年起便一直向校方提供资金。1920年1月，这位“好心人”的身份曝光——是来自纽约州罗切斯特市的工业家乔治·伊士曼。他发明了新的电影制作及编辑方法，并成立了伊士曼柯达公司。1912至1920年期间，伊士曼向麻省理工学院提供了两千万美金（现值两亿三千多万）的现钞及柯达的股票。

2018年10月，麻省理工学院将启用十亿美元建设新的人工智能学院——麻省理工施瓦茨曼计算机学院，致力于将人工智能技术用于该校的所有研究领域。新学院将于2019年9月开学，教学地点被设在了一栋计划于2022年开放的新大楼内。麻省理工施瓦茨曼计算机学院是一个大学范围的实体，将与麻省理工学院现有的五所学院合作，创办25个“桥梁”学院作为2所大学的关键连接点。现阶段预计麻省理工学院的电气工程与计算机科学系（EECS），计算机科学与人工智能实验室（CSAIL），数据、系统与社会研究所（IDSS）以及the MIT Quest for Intelligence将全部成为该大学的一部分，其他单位也可能加入该大学。EECS（特别是该部门的电气工程部分）会继续与现在的工程学院建立牢固的关系。将迅速建立一系列教师委员会，以确定EECS，工程学院和新计算机大学之间的关系以及未来学位课程的范围。