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布里斯托大学生物化学学院的Christiane Schaffitzel教授和马克斯普朗克-布里斯托尔最小生物学中心的Imre Berger教授领导的国际研究团队在Science Advances上发表一项最新研究“The free fatty acid–binding pocket is a conserved hallmark in pathogenic β-coronavirus spike proteins from SARS-CoV to Omicron”在研究...
布里斯托大学生物化学学院的Christiane Schaffitzel教授和马克斯普朗克-布里斯托尔最小生物学中心的Imre Berger教授领导的国际研究团队在Science Advances上发表一项最新研究“The free fatty acid–binding pocket is a conserved hallmark in pathogenic β-coronavirus spike proteins from SARS-CoV to Omicron”在研究中,这一团队对所有冠状病毒的刺突糖蛋白(spike glycoprotein)进行了仔细地检查。刺突糖蛋白简称S蛋白,可结合成蛋白三聚体装饰于冠状病毒的表面,能够与宿主细胞表面受体结合,介导病毒侵入细胞,继而引发广泛的危害。继2020年在新冠病毒的S蛋白中发现了一个“口袋”(pocket)特征后,他们这次发现,这个特别的“口袋”存在于所有致命的冠状病毒中,而那些不具有这一特征的冠状病毒,只会引起轻度的感染和类似感冒的症状。
关于这个“口袋”,研究团队在2020年就已经通过电子冷冻显微镜(electron cryo-microscopy,cryo-EM)以近原子的分辨率对新冠病毒的S蛋白进行成像,并在Oracle高性能云计算的支持下生成了3D结构。出人意料的是,他们在S蛋白的“口袋”中发现了埋藏在其中的小分子游离脂肪酸——亚油酸(linoleic acid,LA)。LA是一种公认的必需脂肪酸,对于许多细胞功能来说都不可或缺,虽然人体不能自行合成,但可以从饮食中吸收。LA还在炎症和免疫调节中起着至关重要的作用,这两者都是新冠肺炎疾病进展的关键因素。LA还被用来维持肺部的细胞膜,使得我们能够正常呼吸。
而LA的存在,起到了闭锁S蛋白三聚体构象的作用。当S蛋白三聚体处于开放构象,将易于与宿主细胞表面的ACE2结合,而当S蛋白三聚体处于闭合构象时,处于非感染性形式,将减少与ACE2的结合。ACE2即血管紧张素转化酶2,已在2020年被确定为新冠病毒的功能性宿主受体。ACE2相当于人体细胞“大门”上的一个锁孔,给予了新冠病毒使用“钥匙”S蛋白开锁进门的可能。
使用新冠病毒感染人类上皮细胞的实验也给出了极具希望的结果,LA补充剂能够与新冠药物协同作用,抑制病毒的复制。先前利用S蛋白中类似的脂肪酸“口袋”开发出来的小分子抗病毒药物在治疗鼻病毒(一种引起普通感冒的病毒)的人体临床试验中取得了成功,病毒表面蛋白被锁定为无法与受体结合的构象。而另一项针对新冠患者血清蛋白质组学和代谢组学的研究表明,患者体内包括LA在内的游离脂肪酸水平均显著降低。